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自序

  昨天公司用张远老师编的教材《家畜育种学》作为教材,从老板到销售,讲解他们的学习经验和各种知识点。我想这应该是扎根行业最鲜明的决心了。了解客户,然后为他们服务。

  我想用两句名言开始这篇序言:

  1、学而后知不足,教而后知难。

  原文是:

  《礼记学记》原创:

  虽然有好菜好吃,但不知道它的用途。虽有无上之学,不知其善。所以是学而后知不足,教而后知难。如果你不够了解,那么你可以反思自己。困了,再自力更生。所以教与学是互相学习的。《兑命》岳:“学一半。”这是什么?

  这句话的意思是:只有学习过才能知道自己知识的不足,只有被教过才能知道自己知识的迷茫。

  我以前是从事教别人数量遗传学的软件的,因为我的客户大部分都是数量遗传学方向的,而且大部分都是育种相关行业。我在里面学到了很多东西,很多我以为自己懂的东西,其实在讲解的过程中发现自己并不知道那么多。你真正了解的东西可以用非常简单易懂的方式解释,我还是用课本的语言。方志:熟悉非真实的知识。

  我一直认为,如果你不知道什么,你应该写一本书。同样,写博客也是一个好方法。表现出你的无知是进步的唯一途径。

  保持饥饿,保持愚蠢

  ――史蒂夫乔布斯

  2、种树最好的时间是十年前,次好的时间是现在

  第一次看到这句话:吴福存的朋友圈被深深触动了。这难免是鸡汤,但人不断学习,拥抱变化的最好时机就是现在。

  我之前学的是植物育种方向。当时听说了《玉米育种红宝书》(《Quantitative Genetics in Genetics in Maize Breeding》),开始系统学习这本书,中间翻译了一些内容。在研究生学习期间,我学习了崔的《数量遗传学》和詹的《高级生物统计学》。这两门课我每次都认真听讲,课后查阅相关资料,受益匪浅。后来工作后接触了动物数量遗传学,更多的是混合线性模型,这无疑让模型更加复杂。目前的工作一般与数量遗传学有关,但它倾向于基因组选择。当然里面的知识更多,但是基础还是数量遗传学和生物统计学。

  之前同事苗建推荐过L. R. Schaeffer的数量遗传学课程。之前看过,重读的时候得到了不同的结果。所谓“一个人玩,不如和别人玩”。这篇学习笔记主要是根据这本教材编写的。

  这本教材好的地方在于不仅讲解了理论,还讲解和练习了数据和代码。代码是R语言的,我会给出Python和Julia的代码供参考。

  教材的大纲:

  基础知识矩阵代数数据处理编写线性模型估计理论预测理论遗传关系平方形式似然法贝叶斯方法爱荷华州立大学课程单一记录重复记录内部遗传效应随机回归模型多性状基因非加性遗传效应减少动物模型幻影分组社会互动模型基因组学简介选举模型同学们说我挖了太多的洞,但挖的洞需要填补,所以最好的策略是将计划公之于众,就像戒烟一样。最好的策略是公开,然后你再抽烟的时候再考虑自己的承诺。

  当然也有人说:戒烟容易。我一个月戒五六次。这也是我写序言的主要原因。

  

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